Program kesiswaan SLB Fisabilillah yaitu terdiri atas:
1. Kegiatan Ektrakurikuler dan Keterampilan
Program Ektrakurikuler SLB Fisabilillah dilakukan setiap hari kamis dan sabtu. Setiap siswa melakukan kegiatan ektrakurikuler yang telah di tentukan oleh guru kelasnya. Dalam menentukan Ektrakurikuler yang akan dilakukan oleh siswa, terlebih dahulu guru-guru melakukan asesmen terhadap masing-masing anak, untuk mengetahui arah kemampuan serta minat dan bakat masing-masing siswa. Adapun bentuk kegiatan ektrakurikuler yang ada di SLB Fisabilillah yaitu:
a. Bola Bocce
b. Bulutangkis
c. Tata boga
d. Perbengkelan
e. Menjahit
f. TIK
g. Kriya Kayu (Pertukangan)
2. Kegiatan Pramuka
Pramuka yang ada pada SLB Fisabilillah yaitu Sianga, Penggalang dan Penegak, kegiatan dilakukan setiap hari rabu. Setiap tahunnya sekolah melaksanakan program pramuka Penegak dan Singgalang di kawasan sekolah untuk siswa siswi.
3. Program Khusus/ Kemandirian
Program khusus yang dilakukan di SLB Fisabilillah yaitu untuk anak dengan kemampuan perkembangan yang kurang. Program khusus di lakukan untuk memenuhi kebutuhan anak berkebutuhan khusus dalam melakukan kegiatan sehari-hari. Sedangkan kemamdirian merupakan program lanjutan program khusus untuk siswa dengan kemampuan perkembangan yang sudah mampu, sehingga program kemamdirian dilakukan untuk mempersiapkan siswa dalam menghadapi kehidupan di lingkungan dewasa dalam bermasyarakat.
